由于对生物很感兴趣,我平时就非常关注生物学科方面的信息和知识。2015年的诺贝尔奖揭晓后,我注意到2015年的诺贝尔化学奖授予给了瑞典、美国、土耳其的三位科学家,以表彰他们对“细胞修复自身DNA的机制”的研究。有“豪华版诺贝尔奖”之称的“生命科学突破奖”2015年颁给了六位科学家,其中美国和瑞典的两位科学家获奖是因为对“基因组编辑CRISPR技术”的研究。该技术基于DNA保护机制。DNA修复与保护技术为什么会受到科学界的重视呢?我带着疑问查阅了很多资料,请教了几位老师,对它进行了初步的探索和分析。
DNA分子独特的双螺旋,具有较稳定的结构;DNA双链提供精确模板,通过碱基互补配对能够保证复制准确进行。怎么会出现差错呢?DNA如何保存自身相对稳定?DNA受到损伤又如何修复?下面结合DNA复制、变异、基因表达等相关知识进行一些分析和探索。
一、DNA的快速复制
在细胞增殖的间期DNA复制,复制需要模板、原料、酶(解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶)、ATP及适宜的温度、pH等条件。遵循边解旋边复制,以解旋的两条亲代母链为模板,按照碱基互补配对原则合成两条子链,新合成子链与母链重新相互盘绕形成两个完全相同的双链DNA分子,表现为半保留复制。
研究发现,37℃时DNA聚合酶Ⅲ催化速率为750个核苷酸/秒,按此速率,含有245 522 847个碱基对的人1号染色体复制约需91h。而人体受精卵经5次有丝***发育成含32个细胞的桑葚胚需3~4天,每个周期至少也得14 h。可见,若要短期内完成DNA复制,除了提高DNA聚合酶活性外,关键是“DNA多起点双向复制”。
(1)多起点双向复制。这是真核生物DNA复制最主要的形式,从一个特定位点解旋得到两条母链,以此作为复制模板,沿着两个相反的方向各延伸出两条链,形成1个复制泡、2个复制叉;2个起点则形成2个复制泡、4个复制叉……这样可以大幅提高DNA复制速率。如***1所示,DNA有两个复制起点O1和O2,各形成两个相反方向的复制叉,相当于形成4个“工作面”,其复制速率就可达1个复制起点时的4倍。
(2)DNA聚合酶。DNA是由两条反向平行的脱氧核苷酸单链相互盘绕而成的。DNA聚合酶只能将单个游离脱氧核苷酸通过形成3′,5′一磷酸二酯键连接到核苷酸链的3′端,换言之,DNA聚合酶只能沿5′3′方向延伸(合成)子链。DNA聚合酶的这一特性使得DNA复制时出现两个有趣现象:①DNA复制需要引物,引物为长度为15~30个碱基的单链DNA或RNA。在DNA人工合成(PCR)中需要加入人工合成的引物,如:一个DNA分子连续复制n次,需要两种引物2n―2个,数量各半。②DNA半不连续复制。DNA是“边解旋边复制”的,故DNA复制时,以3′5′链为模板合成的一条子链延伸方向为5′3′,与复制叉移动方向一致;而另一条以5′3′为模板链合成的子链。延伸方向与复制叉移动方向相反,其合成是不连续的,即先形成许多不连续的片断(称为冈崎片断),再通过DNA连接酶连成一条完整的DNA链。见***2。
DNA合成速率如此之快,复制差错在所难免。此外,各种高能辐射、化学试剂、病毒等物理、化学、生物因素都可能对DNA造成损伤,导致基因突变或染色体结构变异。
二、DNA修复与保护
DNA在生物体内保持稳定,证明存在特殊的DNA修复与保护机制。
(1)重组修复。依据DNA损坏程度可分为单链损伤和DNA双链断裂,前者可利用双链DNA中一段完整的互补链按照碱基互补配对原则修复。双链断裂的DNA则能以其同源染色体DNA为模板,通过同源重组的方式修复。
DNA双链断裂的修复较其他类型的DNA损伤更加困难,修复不当则可能导致染色体缺失、重排、易位和倒位等,从而易于形成肿瘤等疾病。真核细胞具有成对同源染色体,其DNA相应部位具有相同遗传信息(等位基因或相同基因)。如果一条染色体DNA部分缺失。就可以以另一条同源染色体上的DNA进行复制和修复,当然这种修复不可能是100%,因为同源染色体的两个DNA分子的碱基序列并不完全相同,但修复之后一般可保证细胞遗传和代谢的正常进行,毕竟相同位点具有控制相对性状的基因。
(2)端粒的保护。端粒是真核细胞染色体末端的可保护染色体的特殊结构。正常细胞随细胞不断增殖,端粒逐渐缩短,当细胞端粒缩至一定程度,细胞停止***。端粒酶能复制和延长端粒DNA来稳定染色体端粒DNA的长度。端粒酶是由RNA和蛋白质组成的复合物,如人类端粒由6个碱基重复序列TFAGGG和结合蛋白组成,其蛋白质具有催化活性,能以RNA为模板,以端粒3’末端为引物,合成端粒重复序列,故端粒酶属于逆转录酶。
(3)限制酶的保护。限制酶能识别特定的核苷酸序列,并在每条链定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割。限制酶是由细菌产生的,一般不切割自身的DNA分子,只切割外源DNA,其生理意义是提高自身的防御能力。
(4)CRISPR。科学家在对微生物基因组研究时发现,病毒能把自身的基因整合到细菌,利用细菌的细胞工具为自身的基因复制服务,而细菌力***将来自病毒的入侵基因清除,两者共同进化,细菌最终发展出一种CRISPR的系统,利用该系统,细菌可以不动声色地把病毒基因从自身DNA上切除,这是细菌特有的免***系统。如今,CRISPR基因编辑系统被迅速运用到基因敲除动物模型的构建之中,成为生命科学最热门的技术。该技术实质是“RNA干扰”,原理如***3:病毒基因、人工转入基因等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些双链RNA(dsRNA)。宿主细胞利用核酸内切酶迅速将这些dsR-NA切割成多个约21~23个碱基对的小片段RNA(即siRNA)。siRNA在解旋酶的作用下解旋为两条单链RNA,并与外源性基因表达的mRNA的同源区进行特异性结合,最终诱发宿主细胞针对这些mRNA的降解反应。由于dsRNA抑制基因表达具有高效性,任何导致正常机体dsRNA形成的情况都会引起不需要的基因不能表达(称基因沉寂)。当然,机体内正常基因有效表达时,有一套严密防止dsRNA形成的机制。
DNA修复与保护对人类非常重要,以上只是一些基本原理和常识,它还有很多奥妙等待我们去研究、去探索。
作者单位:河南郑州一中龙湖校区高三(1)班